Zoisova nagrada
2018 - dr. Matjaž Perc, FNM
2017 - dr. Zdravko Kravanja, FKKT
2014 - dr. Gorazd MEŠKO, FVV
2013 - akad. dr. Zinka (Terezija) ZORKO, FF
2011 - dr. Matjaž KLEMENČIČ, FF
2010 - dr. Miha Drofenik, FKKT
2009 - dr. Marko JESENŠEK, FF
2007 - dr. Sandi KLAVŽAR, FNM
2006 - dr. Željko KNEZ, FKKT
2001 - dr. Leopold ŠKERGET, FS
1997 - dr. Marko ROBNIK, CAMTP
Zoisovo priznanje
2020 - dr. Samo Kralj, FNM
2019 - dr. Boštjan Brešar, FNM
2014 - dr. Maja RUPNIK, MF
2012 - dr. Samo KORPAR, FKKT
2012 - dr. Mojca ŠKERGET, FKKT
2011 - dr. Valerij ROMANOVSKIJ, FNM
2009 - dr. Matjaž PERC, FNM
2007 - dr. Jože BALIČ, FS
2003 - dr. Matjaž VALANT, FKKT
2001 - dr. Borut ZALAR, FG, dr. Andrej POLAJNAR, FS (s skupino)
2000 - dr. Sandi KLAVŽAR, PEF
1999 - dr. Božidar KRAJNČIČ, FK
1998 - dr. Željko KNEZ, FKKT
Nagrada Republike Slovenije za znanstvenoraziskovalno delo
1996 - dr. Peter ŠEMRL, FS
1995 - dr. Matej BREŠAR, PEF
1993 - dr. Jera VODUŠEK-STARIČ, PEF
..., ki se z letom 1997 preimenuje v Zoisovo nagrado in Zoisovo priznanje.
Puhovo priznanje
2020 - dr. Darko Goričanec, FKKT
Ambasador znanosti Republike Slovenije
2000 - dr. Ludvik TOPLAK, UNIVERZA V MARIBORU
1999 - dr. Andreas MORITSCH, UNIVERZA V CELOVCU, predlagatelj: Univerza v Mariboru
1998 - dr. Jože POGAČNIK, PEF
1997 - dr. Silvo DEVETAK, ECERS, dr. Nada LAVRAČ, FERI
Nagrada Prešernovega sklada
2004 - Oto RIMELE, PEF
2019 - mag. Tomaž SVETE, PEF
Nagrada Republike Slovenije za področje šolstva
2019 - ddr. Boris ABERŠEK, FNM
2017 - Majda Šlajmer Japelj, FZV in dr.Majda Schmidt Krajnc, PEF
2014 - dr. Ivan GERLIČ, FNM
2010 - dr. Peter GLAVIČ, FKKT
2006 - dr. Martin KRAMAR, PEF
2002 - dr. Jože VAUHNIK, PEF
1998 - dr. Jože FLAŠKER, FS